Квант
Основные статьи

Генетика популяций и геометрия

Яглом И. М.

8

Скрещивание с «гибридами». Пусть теперь особи популяции P=P(d,h,r)P = P(d, h, r) скрещиваются только с гибридными особями Н. Рассуждая, как в первом примере, мы получим, что половина потомков попучит от гибридного родителя ген GG, а другая половина — gg, причем в каждой из этих половин особи, у которых вторым геном (наследуемым от родителя из популяции PP) будет GG, составят долю Γ\Gamma, а особи со вторым геном gg — долю γ\gamma. Следовательно, для наследственной популяции P′(d′,h′,r′)P'(d', h', r') имеем

d′=Γ2=d2+h4,h′=Γ2+γ2=12,r′=γ2=r2+h4.d' = \frac{\Gamma}{2} = \frac{d}{2} + \frac{h}{4}, \quad h' = \frac{\Gamma}{2} + \frac{\gamma}{2} = \frac{1}{2}, \quad r' = \frac{\gamma}{2} = \frac{r}{2} + \frac{h}{4}.

Сравнивая координаты точек P′(Γ/2,1/2,γ/2)P'(\Gamma/2, 1/2, \gamma/2) и P0(Γ,0,γ)P_0(\Gamma, 0, \gamma), убеждаемся, что точка P′P' получается из PP приgomетии с центром HH и коэффициентом 1/2 (рис. 4). А это значит, что преобразование f2f_2, переводящей PP в P′P', можно представить как композицию проектарования в направлении hh на прямую, соединяющую середины MM и NN сторона DH и HR нашего треугольника, иgomетии с центром в середине TT отрезка MN и коэффициентом 1/2.

Из этого представления непосредственно видно, что наследственное преобразование f2f_2 сразу преводит треугольник DHR (множество всех популяций) в среднюю линию MN (множество популяций, наполовину состоящих из гибридов) и имеет единственную неподвижную точку (устойчивую популяцию, сохраняющую свой состав) — точку TT (1/4,

Graph

Рис. 4.

Послеовательные поколения P′P', P′′=f2(P′)P'' = f_2(P'), … изображаются точками прямой MN; каждая из них переходит в следующую приgomетию с центром TT и коэффициентом 1/2 (проектировать их, конечно, уже не нужно). Поэтому популяции P′P', P′′P'', … неограниченно приближаются к устойчивой популяции TT.

Задачка 3. Пусть fabcf_{abc} — наследственное преобразование, отвецощее скрещивание популяции P(d,h,r)P(d, h, r) с фиксированной популяцией P(a,b,c)P(a, b, c) (конечно, a,b,c≥0a,b,c \geq 0 и a+b+c=1a+b+c=1); например, f100f_{100} и f010f_{010} — это рассмотренные в тексте преобразования f1f_1 и f2f_2. Запишите формулы преобразования fabcf_{abc} и выясните его геометрический смысл, найдите устойчивые популяции. Что происходит при многократном повторении преобразования fabcf_{abc}?

Панмиксия.
Закон Харди — Вейнберга

Рассмотренные выше наследственные преобразования f1f_1 и f2f_2 имеют, в первую очередь, учебный характер. Гораздо большие значения для популяционной генетики играет наследственное преобразование P′=f(P)P' = f(P), где популяция потомков P′P' получается в пределложении чисто случайного образования пар из состав популяции PP — этот метод образования брачных пар биологически называют панмиксей (полным смешиванием особей популяции). При этом считается, что в jenской и мужской части популяции P(d,h,r)P(d, h, r) доли особей каждой из типов D, H, R одинаковы (и, конечно, равны d,h,rd, h, r). Ясно, что производимый научд выбор брачных пар и последующей выбор пары генов, передаваемой потомку (по одному гену от родителя), можно заменить прямым случайным выбором пары генов из генофона популяции PP. При этом частота, с которой будет возникать пар GGGG (то есть доля d′d' доминантных особей в наследственной популяции P′P'), будет равна Γ2\Gamma^2, частота пар GgGg и gGgG (доля hh гибридных особей) — 2Γγ2\Gamma\gamma, а пар gggg (доля r′r' резессовных особей) — γ2\gamma^2. Итак,

d′=Γ2=(d+h/2)2,h′=2Γγ=2(d+h/2)(h/2+r),r′=γ2=(h/2+r)2d' = \Gamma^2 = (d + h/2)^2, \quad h' = 2\Gamma\gamma = 2(d + h/2)(h/2 + r), \quad r' = \gamma^2 = (h/2 + r)^2

(обратим внимание на то, что d′+h′+r′=(Γ+γ)2=1d' + h' + r' = (\Gamma + \gamma)^2 = 1).

Формулы в рамках выражают один из основных законов популяционной

9

генетики — так называемый закон Харди — Вейнберга, с которой начинается буквально любое изложение этой столь важной сегодня дисциплины; они показывают, как меняется состав популяции при условии «истого смешивания» — при отсутствии каких-либо дополнительных факторов, регуляционных образование брачных пар.

Выясним геометрический смысл преобразования ff (то и есть закон Харди — Вейнберга). Заметим, прежде всего, что состав генофонда популяции P′P' и PP одинаков, поскольку Γ′=d′+h′/2=Γ2+Γγ=Γ(Γ+γ)=Γ\Gamma' = d' + h'/2 = \Gamma^2 + \Gamma\gamma = \Gamma(\Gamma + \gamma) = \Gamma.

Как мы уже знаем, это значит, что точки PP и P′P' лежат на прямой, перpendикулярной стороне DRDR. Положим теперь DP0=xDP_0 = x (рис. 5), тогда γ=r0=xsin⁡60∘=x3/2\gamma = r_0 = x \sin 60^\circ = x\sqrt{3}/2, следовательно,

h′=2Γγ=2(1−γ)γ=3x(1−x3/2).h' = 2\Gamma\gamma = 2(1 - \gamma)\gamma = \sqrt{3}x(1 - x\sqrt{3}/2).

Как известно, в обычной (прямогольной) системе координат (рис. 5) это уравнение при 0≤x≤DR=2/30 \leq x \leq DR = 2/\sqrt{3} задает друг П парабoles; отметим, что в наших «координатах относительно треугольника DHRDHR» она имеет уравнение h2=4drh^2 = 4dr (поскольку h′2=4Γ2γ2=4d′r′h'^2 = 4\Gamma^2\gamma^2 = 4d'r'). Легко проверить, что эта парабола проходит через точки D,RD, R и TT (середину средней линии MNMN) и касается в этих точках прямых DH,RHDH, RH и MNMN.

Таким образом, точка P′=f(P)P' = f(P) лежит на пересечении перpendикуляра DRDR, проведенного через PP, и указанной парабoles, других словами,

HMTRP′\begin{array}{c} H \\ M \\ T \\ R \\ P' \end{array}

Рис. 5.

преобразование ff есть параллельное проектирование треугольника DHRDHR на дуг Π\Pi парабoles в направлении hh.

Отсюда сразу П неподвижны, то есть все популяции PP (d,h,rd, h, r) такие, что h2=4drh^2 = 4dr устойчивы относительно наследственного преобразования ff. Последний результат, в определенном смысле, является парадокальным: из него следует, что в достаточно большой популяции при отсутствии мутации и (искусственного или естественного) отбора эволюция всегда осуществляется за один шаг. Дальнейшее скрещивание особей в таких условиях уже не меняет относительно состав популяции: если P′=f(P)P' = f(P), P′′=f(P′)P'' = f(P'), и т. д., то P′=P′′=…P' = P'' = \dots Оdnako в результате жизни также идеализированные условия скрещивания никогда не имеют места: выполняются они всегда лишь более или менее приближенно. Поэтому и закон Харди — Вейнберга задает лишь первое приближение к реализации условия скрещивания никакются с помощью дальнейших, условиям математических модели (см., например, задачу 4.). Разумеется, полученные с их помощью результаты надо каждой раз сравнить с наблюдающими над живот природой.

Задача 4. Пусть границы пары в популяции PP образуют чисто случайно (как при панмиксини), но грибиды отличаются по жизни способов наследственной популяции в живых остатся лишь kk-я часть (при k>1k > 1 это означает, что направить, сохраняться лишь (1/k)(1/k)-я часть особей типов DD и RR). Опишите соответствующее геометрическое преобразование треугольника DHRDHR. Как оно устроено при k=0k = 0 (полное вымирание грибидов) и при k=∞k = \infty (полное вымирание особей DD и RR)?

Закон Харди — Вейнберга был независяimo открыт в 1908 г. в Кембридже молодым английским математиком Годфри Харольдом Харди и в Вене авторский врачом Вильгельом Вейнбергом. (Воспел逮ии историки науки установили, что пятую годами раны тот же закон — в несколько других его формы — был указан английским биологом У. Е. Кастлом, работа которого, од-

10

нако, никак не была заменена.) Любопытно отметить, что выдающийся специализит в области теории чисел Г. Х. Харди является воинственным адептом «чисой» науки: в своей научной авторографии «Апология математика» (к сожалению, эта интересная книга на русский язык не переведена) он с темпераментом доказывает премиущества яркой и богатой идеями «чисой» математики перед «прикладной» науки, совершенно незаслуженно казавшейся ему скучной; хорошо курс математического анализа Харди вызывающе назван «Курсом чисой математики». Оdnako сегодня более 90 % всех упоминаний имени Харди в научной и учебной литературе связано не с его выдающимся работами теоретического содержания, а с единственным юношеским его «грехом» — с выполненной в молодости прикладной работе по популяционной генетике, содержание которого мы только что изложили.

Поговорим о дальнейшем

Выше мы рассмотрели самую простую генетическую схему, когда какой-то признак, проявляющийся в двух вариантах, определяется парой генов, каждой из которых может быть двух типов. Оdnako и число генов, и число их различных типов, да и законы их внешнего проявления могут быть другими. Об одной из таких более сложных систем передачи наследственных признаков мы сейчас коротко расскажем.

Известны наследственные признаки, встречающиеся уженшин гораддо режке, чем у мужчин. К ним относятся, например, гемофилия (несвертываемость крыви) и цветовая слепота (несспособность различать некоторые цвета, чашце всего красный и зеленьй). Вторую из этих более_NEW впервые описал страдавший его знаментийный англійский химик Дж. Дальтон (1766—1844); по его имени она вписледствии была назван «дальтонизмом». Сам Дальтон считал, что это мужская более_NEW. Здесь он ошибался, что и не удивительно: по статистике дальнейто 8 % среди мужчин и только 0,5 % среди женши. Причина этого различия объясняется в так называемой X-хромосоме. Эта хромосома вместе с другой — Y-хромосомой — определяет пол человек*): в клетках jenского организма имеет по две

*) Так же обстоит дело у других млекопитающих и неокторы насекомых.